OBJETIVO: Objetivou-se conhecer a opinião dos residentes envolvidos em dois Programas de Residência Multiprofissional em Saúde (RMS), um financiado pelo Ministério da Educação e outro pelo Ministério da Saúde. MÉTODOS: Estudo exploratório descritivo qualitativo e quantitativo, com Análise de Conteúdo de Bardin. Participaram 38 residentes dos dois Programas de RMS, vinculados a duas Instituições de Ensino Superior (uma pública e outra privada), do Rio Grande do Sul. RESULTADOS: As potencialidades apontadas pelas categorias foram: a qualificação e status e benefícios econômicos. As categorias indicando as fragilidades foram: deficiência entre o ensino e o serviço, diferenças profissionais e falta de reconhecimento. Quanto às sugestões emergidas para a melhoria dos Programas surgiram as categorias: qualificação do Programa, comunicação efetiva interpessoal e flexibilização da legislação. CONCLUSÃO: Percebeu-se que as opiniões dos residentes dos dois Programas de RMS foram semelhantes, mesmo sendo Programas diferentes.