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Estudos recentes sobre o torque teno vírus (TTV), gênero Anellovirus, possibilitam construir a hipótese de que este vírus possua um fator patogênico causando infecções ou co-infecções non sistema respiratório. O objetivo deste trabalho é detectar a presença do vírus TTV em amostras de pacientes com infecção respiratória. Foram utilizadas 50 amostras de escarro provenientes de 30 pacientes com diagnóstico de tuberculose negativa e HIV negativo e 20 pacientes com tuberculose negativa e HIV positivo. O DNA viral foi extraído das amostras utilizando a técnica de ultrassom e amplificado utilizando a técnica de PCR. Foi detectada a presença do vírus TTV em 13 (26%) do total das 50 amostras. Com relação às 30 amostras TB negativas e HIV negativas, 6 (20%) apresentaram o vírus e em relação às 20 amostras com TB negativas e HIV positivas, 7 (35%) apresentaram o TTV. Considerando esses percentuais, a presença do vírus não foi significativa mas amostras utilizadas, o que pode resultar da hipótese do DNA do vírus ter pouca prevalência em materiais provenientes do sistema respiratório, além da possível limitação em relação à quantidade de amostras utilizadas.