Salmonella é um dos principais patógenos bacterianos com a capacidade de causar doenças a partir do consumo de alimentos contaminados de origem animal. A maioria dos registros de surtos de salmonelose em humanos é causado pelos sorotipos patogênicos Enteritidis e Typhimurium. O presente estudo objetivou amplificar as duas regiões espaçadoras intergênicas (ISR1 e ISR2) presentes no operon rrnB para discriminar sorotipos das amostras. Foram utilizadas 42 amostras provenientes de laboratórios vinculados a granjas comerciais do Brasil. Os isolados foram confirmados para o gênero Salmonella através da amplificação do gene invA apresentando um Ct médio de 22,6, variando de 14,7 a 33,2. A região espaçadora intergênica (ISR) de interesse foi amplificada por PCR (polymerase chain reaction) convencional utilizando primers específicos e seus produtos foram submetidos à detecção por eletroforese em gel de poliacrilamida corado com nitrato de prata. Vinte e cinco amostras amplificaram para as regiões de interesse, apresentando os sorotipos Enteritidis (n=7), Gallinarum (n=3), Agona (n=1), Schwarzengrund (n=1), Rissen (n=1) Heidelberg (n=3), Grupo B (n=1), Grupo D (n=1), Mbandaka (n=1), Pullorum (n=1), spp. (n=3) e Typhimurium (n=2), onde foi possível observar que estes sorotipos apresentaram um padrão de amplificação (bandeamento) distintos entre si.